Já ouvi falar várias vezes que DBAs que tiveram algum problema onde alguns dados do banco foram corrompidos já sairam do sufoco ao realizar este procedimento (apagar a tabela diretamente no SMI).
Eu particulamente já estive na situação de utiliza-lo, porém como não gosto de arriscar principalmente em ambientes de produções, decidi avaliar a situação em um ambiente de testes. E o resultado não me surpreendeu.

Nos testes realizados, após corromper os dados manualmente de modo que prejudicou qualquer manutenção na tabela e indice , tentei exclui-los da SMI e apenas carretou mais problemas com o banco.